V roce 2029 jsou lidská těla i vzpomínky stále těsněji propojené s kybernetikou. Sekce 9 dostává za úkol vypátrat hackera přezdívaného Puppet Master, který dokáže zasahovat přímo do lidské paměti a používat cizí těla jako nástroje bez vědomí jejich majitelů.
Kde končí člověk, když lze přepsat jeho paměť
Ghost in the Shell staví policejní pátrání na otázce identity. Major Motoko Kusanagi má sama rozsáhle kybernetické tělo, takže případ pro ni není jen technickým problémem. Čím víc se vyšetřování přibližuje Puppet Masterovi, tím obtížnější je oddělit vědomí, tělo a data.
Film kombinuje akční sci-fi s filozofičtějším pohledem na technologii. Nebezpečí nepředstavuje jen hacker, který proniká do sítí, ale možnost, že člověk přestane mít jistotu, zda jeho vlastní vzpomínky opravdu patří jemu.
